POSTER ABSTRACTS / RESUMOS DE POSTERS

 

P-17

Citogenética de próxima geração: implementação e primeiros resultados em Portugal

 

 

Dezso David¹; Natália Oliva-Teles^2,3; J Freixo⁴; Ana Fortuna^2,3; Natalyia Tkachenko²; Isabel Carvalho⁴; M Marques¹; M Cardoso¹; J Fino¹; Bárbara Marques¹; AC Alves¹; Sofia Dória⁵; Carla Pinto de Moura⁵; Isabel Marques Carreira⁶; Hildeberto Correia¹; RM Gonçalves⁴; João Lavinha¹; Teresa Kay⁴; Michael E Talkowski⁷; Cynthia Casson Morton⁸

¹Departamento de Genética Humana, Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge, Lisboa
²Centro de Genética Médica Dr Jacinto Magalhães, Centro Hospitalar do Porto, Porto
³Unidade Multidisciplinar de Investigação Biomédica (UMIB), Instituto de Ciências Biomédicas Abel Salazar (ICBAS), Universidade do Porto, Porto
⁴Serviço de Genética, Centro Hospitalar de Lisboa Central, Lisboa
⁵Faculdade de Medicina, Universidade do Porto, Porto
⁶Faculdade de Medicina, Universidade de Coimbra, Coimbra
⁷Center for Human Genetic Research, Massachusetts General Hospital, Boston, USA
⁸Department of Obstetrics and Gynaecology and Pathology, Brigham and Women’s Hospital, Harvard Medical School, Boston, USA

E-mail: natalia.teles@chporto.min-saude.pt

 

 

Introdução: As alterações cromossómicas estruturais pro- vocam doenças de severidade variável que acarretam sofrimento individual e familiar significativo. Para compreensão da sua etiologia e estabelecimento de um possível prognóstico, uma adequada correlação fenótipo-genótipo é fundamental. O presente estudo faz parte do projeto intitulado l1lCitogenética de Próxima Geração Irrompe nos Cuidados de Saúde e Con- tribui para Anotação do Genoma Humanol1l, que visa a introdução da sequenciação de próxima geração (NGS) na citogenética clínica, tirando partido dessa inovação única na deteção de variantes estruturais, com uma resolução de um nucleótido para a criação de uma citogenética de alto rendimento, catalisadora de notáveis avanços no diagnóstico clínico e resulta da colaboração entre seis Instituições nacionais e a Harvard Medical School. Estima-se que exista um número considerável de indivíduos portadores de diversas patologias, incluindo algumas de início tardio associadas a rearranjos genómicos por identificar. Assim, é fundamental a identificação e a referência destes indivíduos com possíveis rearranjos cromossómicos associados a doenças.

Material e Métodos: Ate à data, cerca de 20 indivíduos ou famílias foram incluídos neste estudo. Estes cumpriam os requi- sitos de admissão estabelecidos, i.e., anomalias cromossómicas (translocações e inversões equilibradas) associadas a fenótipos (ex: malformações congénitas, ADPM, infertilidade recorrente específica, e doenças de início tardio, incluindo oncológicas). Destes, em 16 foi aplicada a sequenciação de próxima geração utilizando bibliotecas de sequenciação de grandes insertos.

Resultados: A análise comparativa de uma translocação dupla demonstrou que a abordagem baseada em NGS é capaz de identificar o espetro completo de alterações estruturais que não tinham sido previamente identificadas pelas metodologias clássicas e confirmou que, na grande maioria dos casos, estamos na presença de alterações estruturais simples, equilibradas ou não, embora em três casos tivessem sido identificados rearranjos cromossómicos complexos e, num quarto, chromothripsis. Duas das amostras analisadas tiveram origem pré-natal. No total foram identificados mais de 50 pontos de quebra e um conjunto de possíveis genes candidatos.

Conclusões: A aplicação desta metodologia permitirá, sem dúvida, a introdução da Citogenética de Próxima Geração nos cuidados de saúde e contribuirá significativamente para me- lhorar a predição das consequências clínicas dos rearranjos cromossómicos detetados em prée pós-natal. A análise de amostras de origem pré-natal demonstrou a viabilidade desta abordagem no estudo de anomalias cromossómicas detetadas no feto. Adicionalmente, o presente estudo dará importantes contribuições para a anotação do genoma humano.

Projeto cofinanciado pela Fundação para a Ciência e Tecnologia (HMSP-ICT/0016/2013).