Abstract

LOURENCO, Darling de Andrade; LEON, Priscila Marques Moura de; SANTOS, Luís  and  CHOUPINA, Altino Branco. Molecular factors associated with pathogenicity of Phytophthora cinnamomi. Rev. de Ciências Agrárias [online]. 2019, vol.42, n.4, pp.211-220. ISSN 0871-018X.  https://doi.org/10.19084/rca.18577.

Phytophthora cinnamomié um patógeno do solo que possui uma ampla gama de hospedeiros em diversos países de diferentes climas. Esse fungo é responsável pela doença da tinta do castanheiro europeu (Castanea sativaMiller) e conduz à morte da árvore. Portugal se destaca na produção do castanheiro europeu. Entretanto, entre 2002 e 2004, houve uma redução de 27.3% na área de distribuição dessa área devido ao P. cinnamomi. O objetivo deste trabalho foi identificar fatores moleculares possivelmente associados à patogenicidade do fungo através de sequências genômicas depositadas no NCBI utilizando ferramentas de bioinformática. O primeiro contig foi utilizado e as ORFs presentes nas sequências foram identificadas. Foi utilizado o smartBlast em busca de proteínas homólogas. A predição da localização celular das proteínas foi feita através de quatro ferramentas: SignalP 4.1, Cello v.2.5, LOCTree3, Euk-mPLoc 2.0. A caracterização dos domínios dos produtos foi realizada utilizando o PROSITE e a predição das estruturas foi realizada utilizando o servidor Phyre2. Foram encontradas 13 proteínas provavelmente associadas com a patogenicidade de P. cinnamomie as suas propriedades relacionadas com a infecção foram analisadas in silico.Esses resultados são importantes uma vez que são uma primeira etapa na busca por fatores patogênicos.

Keywords : Tinta do castanheiro; Oomycetes; Infecção; Bioinformática.

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